由于法兰螺母尺寸较小，形状不规则、有的还需要螺纹配合，所以热浸镀锌存在一些明显的缺陷。
1、镀后螺纹拧合困难。热浸镀锌后余锌粘留在螺纹中不容易去除干净，而且锌层厚薄不均匀，影响了螺纹件的配合。在GB/T13912—1992《金属覆盖层钢铁制品热浸镀锌层技术要求》、GB/T2314—1997《电力金具通用技术要求》中规定；紧固件的外螺纹应在热浸镀前按GB196标准规定加工或辗制，而内螺纹可在热浸镀前或后进行加工。但在实际应用中客户往往要求内外螺纹均有镀锌层，故人们采用多种措施来解决螺纹配合件的热浸镀锌问题。如螺纹件镀后的回攻；预留较大配合间隙；离心甩等方法。回攻容易破坏螺纹部分镀层,甚至裸露钢铁基体,造成紧固件锈蚀。故意超范围加大螺母孔径或预留配合间隙，很容易降低配合强度，对于高强度配合这是不允许的。
2、热浸镀锌操作温度高，会降低高强度法兰螺母的机械强度。8.8级螺栓经热浸镀锌后部分螺纹的强度低于标准要求;9.8级以上的螺栓经热浸镀锌后的强度基本上无法达到要求。5
3、工作环境差，污染严重。紧固件热浸镀锌过程是在高温下进行，溶剂烘干和待镀工件浸锌入池时会析出强烈刺激性的录化氢气体；锌池长时间处于高温下，锌池表面产生锌蒸气，整个工作环境的气氛恶劣。
紧固件热浸镀锌虽然存在多种缺陷，但因为热浸镀锌的镀层厚、结合强度好、长期腐效果佳。在电力、通讯、交通部门一直受到推崇。
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